Musyawarah Besar atau Mubes merupakan Badan Kelengkapan HIMAKA FMIPA Unpad yang berfungsi sebagai badan struktural tertinggi yang membawahi Badan Eksekutif (BE), Badan Perwakilan Angkatan (BPA) dan Divisi (GANALA).

Mubes HIMAKA FMIPA Unpad melantik keanggotaan pada badan eksekutif atau pun legislatif di HIMAKA FMIPA Unpad. Dalam keanggotaan mubes HIMAKA FMIPA Unpad terdiri tiga presidium selaku pemegang kekuasaan sidang, yaitu Presidium I, Presidium II dan Presidium III yang umumnya berasal dari 3 angkatan termuda. Secara umum Presidium I bertugas memimpin sidang, Presidium II bertugas untuk mencatat jalannya sidang, dan Presidium III bertugas sebagi pengingat waktu. Terlepas dari itu, tugas masing-masing presidium bisa berganti-ganti sesuai kondisi dan situasi.